巴氏奶和常温奶的生产过程都涉及到了通过加热杀死的热处理，所以都会在一定程度上破坏一些对热敏感的营养成分。不过由于常温奶经历了更严酷的热处理，在杀死更多的的同时，也不可避免地“牺牲”了相对更多的营养物质，比如一些维生素和可溶性蛋白。就营养成分和口感来说，巴氏奶的确是比常温奶更好一些。
但是，常温奶在营养成分上的牺牲，换来了在保存上的便利以及价格上的低廉。它不仅不需要像巴氏奶那样必须在4摄氏度下保存，而且保质期远长于巴氏奶（90天 VS 7天）。由于较长的保质期和储存运输过程不需要冷藏，常温奶通常在价格上也比巴氏奶稍微便宜一点。
有人说总数过高的牛奶做不成巴氏奶，其实也不，只需要稍微提高巴氏的温度，或者延长几菌时间，仍然可以得到指标符合标准的“巴氏奶”。所以，能不能做成巴氏奶不可能成为衡量生乳质量的标准。更有甚者，部分小企业有可能用经过了UHT的牛奶来冒充巴氏奶销售，他们的逻辑是，反正一般的消费者也尝不出二者的区别，只要他们喝了不拉肚子就没事。
鱼与熊掌，可否兼得？
虽说目前为止，还没有可靠的办法能够使产品既保持像巴氏奶那样的营养和口感，又可以有像常温奶那样长的保质期，但是的确有一种比巴氏和UHT更好的办法来为牛奶，那就是微过滤（microfiltration）。
牛奶微滤的方法就是先把牛奶脱脂，然后让脱脂奶在较低的温度（50度左右）通过微滤膜。微滤膜就好像一个“筛子”，这个筛子的网孔不大不小，直径正好1.4微米，牛奶中的营养成分可以顺利透过筛子，而由于个头比较大，无法穿过，就被截留了下来。
由于牛奶中的脂肪也属于大个头的，所以才需要事先脱脂。之后，会单独把脂肪进行热处理（脂肪很耐热），再根据需要按照比例，将其与脱脂奶混合以生产半脱脂或全脂牛奶。由于在这种工艺中牛奶的主要成分都没有受到高热，其营养成分和口感几乎和新鲜生乳一样，比巴氏奶还要好。而且，这种经过微滤处理的牛奶的保质期也比巴氏奶要长，4摄氏度下可以保存3周左右，为了保险起见，通常商家规定的保质期是15天。 不过微滤奶的保质期还是没有常温奶那么长，也需要冷藏，因为微滤并不能使牛奶中的一些酶失活，时间长了这些酶仍然会使牛奶变质，温度高了也会加速变质的速度。
但是，虽然这种微滤的牛奶明显要好于目前常用的巴氏，单单生产的成本也并不比普通的巴氏高，但是由于需要引入新设备，所以这项技术目前在世界上尚未被广泛应用。
全世界人民都喝巴氏奶？
美国、澳大利亚和新西兰，市场上也是巴氏奶占主导地位。这些不同国家之间的差异，主要的原因是饮食文化上的区别。
比如法国常温奶占牛奶消耗量的95.5%，并不意味着法国人“只喝”常温奶，实际上法国人平时乳品的摄入主要是奶酪（常温乳制品），而法国家庭购买牛奶主要用途是做甜品——不需要冷藏而且保质期长的常温奶自然是的选择。
相反，欧洲较高纬度地区的国家，以及美国和澳大利亚等国，长期以来有饮用牛奶的习惯，且消耗量较大，因而口感好且更有营养的巴氏奶就成了的选择。